墨西哥海关清关效率低下的原因主要涉及以下几个方面：

1. 复杂的管理体系：墨西哥海关的管理涉及多个部门，如财政部海关总署（SAT）、经济部、农业部、公共安全和司法部以及外交部等，这些部门间的职权划分不明确，导致决策和执行过程中可能存在协调不畅的问题。

2. 内部贪污腐败：墨西哥海关内部存在贪污和腐败现象，这不仅影响了正常的工作流程，还可能导致额外的非正式费用，延长了货物处理时间。

3. 法规与政策频繁变动：墨西哥政府可能会频繁调整进口政策和关税结构，以适应经济或保护本土产业的需要，这种变化增加了合规的复杂性，使得清关流程更加繁琐。

4. 严格的审核标准：由于对知识产权的严格保护和对特定商品的详细审查要求，每个进口批次都需要详尽的文件证明，这在一定程度上拖慢了清关速度。

5. 查验程序复杂：红绿灯抽查系统和Tactical Force的二次查验机制，虽然旨在确保合规，但也增加了不确定性，一旦被选中，可能面临长时间的等待。

6. 资源分配与技术限制：海关设施的资源分配不足，以及可能的技术落后，影响了处理大量货物的能力，尤其是在高峰时段。

7. 法律责任风险：由于严格的法律责任，海关代理和进口商在处理货物时格外谨慎，进行预检以避免法律问题，这也延长了准备时间。

8. 外部因素：如政治事件、安全问题或国际关系的变化也可能间接影响海关的运作效率。

综上所述，墨西哥海关清关效率低下的原因是多方面的，既包括制度和管理层面的问题，也涉及到实际操作中的复杂性和外部环境的影响。